109火之意志
便于忍界更好的交流与发展，这也就是说明精神能量不是查克拉的一部分；但后来，人们不再使用查克拉连接精神能量，而是用查克拉连接自己的精神能量和身体能量，和辉夜一样，把查克拉作为一种武器，这样就是说明，查克拉实际上是“一把钥匙”，一把连接身体能量和精神能量的钥匙（或者连接精神能量与精神能量；根据仙术的作用机制，也可以连接自然能量）。
据宇智波斑所说，神树是天地创始之物，被人类尊为神柱，顶礼膜拜。神树从未卷入过任何人类的战乱。神树是一切查克拉的根源。所有的忍界忍者身上的查克拉皆源自神树。突然有一天，神树上竟结出圣果，圣果一千年才会结出一次。但人类的祖祖辈辈皆留下祖训，万万不可染指圣果。但是由于人类无休止的战乱，一名公主求胜心切，竟偷食了圣果。她的名字叫做大筒木辉夜。传闻公主之后得到了神的力量，凭一己之力平定了战乱。这位公主是第一个拥有查克拉的人类。她的儿子体内与生俱来就具有了查克拉。而被夺去圣果的神树为夺回查克拉，变化为十尾的模样，开始暴走，这就是十尾。漫画中明确指出，十尾实际上就是大筒木辉夜意志的化身。大筒木辉夜的儿子成功地阻止了十尾，他的名字叫做大筒木羽衣，他阐明了查克拉的真理，开创了忍宗，是忍者的始祖。他还有一个名字叫做“六道仙人”。即使石碑被黑绝少量改动，但《阵之书》明确指出，辉夜是“查克拉之祖”，证明了查克拉的起源。根据博人传大筒木一族可以得知星球本身就存在查克拉与神树无关。
查克拉的广泛传播推动忍界的独特秩序的演变与发展，也使得氏族的能力在一定方向上有了突出的外在体现，也使得这种最原始的组织形式始终存在于忍界社会的历史中。这种稳定存在使得氏族逐渐成为了在经济、政治、意志等各方面都具有了一定能力的社会单位，也成为了忍界社会的重要突出标志。
阴的性质变化与阳的性质变化是查克拉特殊的性质变化。阴的性质变化与阳的性质变化又称阴遁和阳遁。阴遁，利用精神能量，能从无中创造出物质形象。阳遁，利用身体能量，将查克拉或意志注入无机物，使其拥有生命。《阵之书》明确指出，六道仙人调和阴遁和阳遁，使用阴阳遁之术开发出“万物创造之术”，并非使用阴遁之术和阳遁之术创造世界。阴的性质变化比如奈良一族的影子束缚术、山中一族的心灵忍术等，而阳的性质变化比如秋道一族的倍化术、医疗忍术等。性质的判定在开始修行之前，必须先知道适合自己查克拉的“性质”到底是哪一种。一般会将查克拉注入查克拉感应纸，查看纸张的变化来确认。
相同性质的术碰撞在一起，依据用来施术的查克拉量判断结果。如果查克拉量相同，双方的术就会相互抵消。不过要是施术者使用比较多查克拉（相同的术，查克拉更多的一方，术的状态更高，例如”状态2“高于”状态1“），有时候就能用自己的术压倒对手，这时战败的一方因为也会被自己施展的术命中，所以在这种状况下，战败时受到的伤害也特别大。
大体上每个人天生都有查克拉属性，和性质变化修行无关。如鸣人的风遁一直存在，只是自己不清楚。但也有人拥有查克拉，而他的查克拉没有具体的属性。如小李，在漫画凯与鬼鲛战斗的情节中，小李运用查克拉站在水面上；而在漫画中忍考试小李对战我爱罗时，凯明确指出，小李大体不会忍术和幻术，而非没有查克拉。在《阵之书》的设定中，小李没有查克拉属性。
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